En los laboratorios del CiiCC se han realizado proyectos de investigación relacionados con ecología de animales calcificantes en relación a la problemática de acidificación del océano. Durante los últimos años, se han ejecutado experimentos de campo y de laboratorio en conjunto con varias universidades, adscritos en proyectos FONDECYT, ANILLOS y MILENIO. Este laboratorio ha dirigido y coordinados actividades de investigación en ecología pioneras en Chile, y los resultados de estas investigaciones comienzan a ser publicados en revistas científicas de primer nivel.
Como segunda línea de acción, se ha desarrollado fuertemente actividades de difusión científica y educación ambiental en el marco del programa EXPLORA-CONICYT, participando activamente en la transmisión de conocimientos relacionados con Cambio climático y acidificación del océano.